Ciljevi i zadaci lekcije: formirati koncept o nukleinskim kiselinama; formirati pojam o nukleinskim kiselinama; razmotriti građu i funkcije nukleinskih kiselina; razmotriti građu i funkcije nukleinskih kiselina; naučiti sposobnost usporedbe DNA i RNA; naučiti sposobnost usporedbe DNA i RNA; demonstrirati tehnike korištenja teksta pri sastavljanju tablice; demonstrirati tehnike korištenja teksta pri sastavljanju tablice; naučiti kako riješiti probleme iz molekularne biologije na temu DNK naučiti kako riješiti probleme iz molekularne biologije na temu DNK
Nukleinske kiseline - od latinskog “nucleus” - jezgra Švicarski liječnik Johann Friedrich Miescher 1871. godine otkrio je novu tvar, nuklein, u gnoju. Bio je to samo švicarski liječnik Johann Friedrich Miescher koji je 1871. godine u gnoju otkrio novu tvar, nuklein. Bile su mu samo 23 godine. star 23 godine. Njegov učenik Richard Altmann 1889. preimenovao je nuklein u nukleinsku kiselinu Njegov učenik Richard Altmann 1889. preimenovao je nuklein u nukleinsku kiselinu
Postoje dvije vrste nukleinskih kiselina Postoje dvije vrste nukleinskih kiselina Dezoksiribonukleinska kiselina (DNK), koja uključuje ugljikohidrate - deoksiribozu Deoksiribonukleinska kiselina (DNK), koja uključuje ugljikohidrate - deoksiribozu Ribonukleinska kiselina (RNA), koja uključuje ugljikohidrate - ribozu . Ribonukleinska kiselina (RNA), koja sadrži ugljikohidrat ribozu.
Godine 1962. Nobelovu nagradu za otkriće strukture molekule DNA dobili su: američki biokemičar James Watson američki biokemičar James Watson engleski znanstvenik Francis Crick engleski znanstvenik Francis Crick engleski biofizičar Maurice Wilkins engleski biofizičar Maurice Wilkins
Struktura DNK DNK je dvostruki nerazgranati polimer savijen u spiralu DNK je dvostruko nerazgranati polimer savijen u spiralu DNK je biopolimer čiji su monomeri nukleotidi DNK je biopolimer čiji su monomeri nukleotidi Svaki nukleotid se sastoji od: Svaki nukleotid se sastoji od: 1 dušična baza - 1. dušična baza - adenin (A), citozin (C), gvanin (G) ili timin (T); adenin (A), citozin (C), gvanin (G) ili timin (T); 2. monosaharid – deoksiriboza; 2. monosaharid – deoksiriboza; 3. ostatak fosforne kiseline 3. ostatak fosforne kiseline
Kasnih 1940-ih, američki biokemičar rođen u Austriji Erwin Chargaff otkrio je da sva DNK sadrži jednak broj baza T i A i, slično tome, jednak broj baza G i C. Međutim, relativni sadržaj T/A i G/C u molekuli DNA specifičnoj za svaku vrstu.
Funkcije DNK Pohranjivanje genetskih informacija Pohranjivanje genetskih informacija Prijenos genetskih informacija od roditelja na potomke Prijenos genetskih informacija od roditelja na potomke Implementacija genetskih informacija u procesu života stanice i organizma Implementacija genetskih informacija u procesu života stanice i organizma
Struktura RNK RNK je biopolimer čiji su monomer nukleotidi RNK je biopolimer čiji su monomer nukleotidi RNK je jedan polinukleotidni niz. RNA virusi mogu biti jednolančani ili dvolančani RNA – jedan polinukleotidni niz. RNK virusa može biti jednolančana ili dvolančana Svaki nukleotid se sastoji od: Svaki nukleotid se sastoji od: 1. Dušične baze A, G, C, U (uracil) 2. Monosaharida - riboze 3. Ostatka fosforne kiseline Vrste nukleotida RNK: Adenil, gvanil, citidil, uridil Vrste nukleotida RNA: adenil, gvanil, citidil, uridil
Vrste RNA. Prijenosna RNA (tRNA). Molekule tRNA su najkraće. Prijenosna RNA se uglavnom nalazi u citoplazmi stanice. Funkcija je prijenos aminokiselina do ribosoma, do mjesta sinteze proteina. Od ukupnog sadržaja RNA u stanici, t-RNA čini oko 10%. Ribosomska RNA (r-RNA). To su najveće RNA. Ribosomska RNA čini bitan dio strukture ribosoma. Od ukupnog sadržaja RNA u stanici, r-RNA čini oko 90%. Messenger RNA (i-RNA), ili messenger RNA (m-RNA). Sadržano u jezgri i citoplazmi. Njegova funkcija je prijenos informacija o strukturi proteina od DNK do mjesta sinteze proteina u ribosomima. mRNA čini približno 0,51% ukupnog sadržaja RNA u stanici.
Zadaci iz molekularne biologije 1. Dio jednog od dvaju lanaca molekule DNA sadrži 300 nukleotida s adeninom (A), 300 nukleotida s adeninom (A), 100 nukleotida s timinom (T), 100 nukleotida s timinom (T) , 150 nukleotida s gvaninom (G), 150 nukleotida s gvaninom (G), 200 nukleotida s citozinom (C). 200 nukleotida s citozinom (C). Koliko nukleotida s A, T, G, C sadrži dvolančana molekula DNA? Jesu li A, T, G, C sadržani u dvolančanoj molekuli DNK?
Korišteni izvori V.V. Pčelar "Biologija" 9. razred, Moskva, "Droplja", 2011. V.V. Pčelar "Biologija" 9. razred, Moskva, "Droplja", 2011. V.V. Pasechnik “Tematsko i nastavno planiranje za udžbenik”, M, “Drofa”, 2011. V.V. Pasechnik “Tematsko i nastavno planiranje za udžbenik”, M, “Drofa”, 2011. Internet: Yandex - slike Internet: Yandex - slike
Slajd 2
Plan
- struktura RNA
- Vrste RNA
- Funkcije
- Ribosom, njegova struktura i funkcije
- Transkripcija u prokariota
Slajd 3
struktura RNA
Molekula RNA sastoji se od jednog polipeptidnog lanca; on je kraći od lanca DNA. Postoje 4 vrste dušičnih baza u nukleotidima RNA: A, G, C, U; RNA sadrži ugljikohidrat ribozu i ostatak fosforne kiseline.
Slajd 4
Vrste RNA
- Messenger/glasnička RNA – sadrži od nekoliko 100-1000 nukleotida, otvorenog je lanca, prenosi informacije o strukturi proteina od DNA do ribosoma.
- Ribosomska RNA dio je ribosoma i obavlja strukturnu funkciju, sudjeluje u sintezi polipeptidnog lanca, čini 85% sve RNA, prokariotske stanice sadrže 3 tipa r-RNA, a eukariotske stanice sadrže 4 tipa.
- Prijenosna RNA - prenosi aminokiseline do mjesta sinteze proteina na ribosomima, svaka molekula tRNA sadrži 80 nukleotida. Njegova specifičnost određena je strukturom antikodona - to je mjesto povezivanja s određenim tripletom mRNA.
- Heterogena nuklearna RNA (hn-RNA) preteča je i-RNA u eukariota i pretvara se u i-RNA kao rezultat procesiranja. Normalna RNA je duža od i-RNA.
- Mala nuklearna RNA (snRNA) – sudjeluje u procesu pretvorbe snRNA
- RNA početnica je sićušna RNA koja se sastoji od samo 10 nukleotida i uključena je u proces replikacije DNA.
Slajd 5
rRNA je strukturni okvir ribosoma
- Na to se nanižu bjelančevine
- Sekundarna i tercijarna struktura male podjedinice 16S rRNA
Slajd 6
Prijenosne RNA
Slajd 7
Glasnička RNA
Slajd 8
Vrste RNA
Sve vrste RNA nastaju kao rezultat reakcije sinteze predloška; u većini slučajeva jedan od lanaca DNA služi kao predložak. Sinteza RNA na DNA šabloni je proces koji se naziva transkripcija, u kojem sudjeluju enzimi RNA polimeraza (transkriptaza).
Slajd 9
Funkcije RNA
- M-RNA djeluju kao uzorci za sintezu proteina i određuju slijed aminokiselina proteina.
- R-RNA djeluju kao strukturne komponente ribosoma.
- T-RNA – sudjeluju u prevođenju informacija m-RNA i slijedu proteinskih aminokiselina.
Slajd 10
Najveći i najsloženiji molekularni strojevi
Slajd 11
Slajd 12
Transkripcija u prokariota (ili sinteza RNA)
Ovo je sinteza predloška ovisna o DNK, koja se može podijeliti u tri faze, te faze čine cijeli ciklus transkripcije - ovo je enzimski proces u kojem se genetske informacije sadržane u jednom lancu DNK prevode kao rezultat sinteze glasnika RNA u nukleotidnu sekvencu ove RNA.
Slajd 13
Nužni uvjeti za biosintezu RNA
- Prisutnost DNA matrice
- Prisutnost 4 vrste nukleotida: ATP, GTP, UTP, CTP.
- enzim RNA polimeraza
- Proteinski faktori
- Anorganske komponente (magnezij, mangan)
Slajd 14
Struktura operona
- Jedinica transkripcije je transkripton/operon - to je dio DNK koji je na kraju omeđen 5. promotorom i 3. terminatorom.
- R – regulator gena
- P - promotor je dio DNA koji se čvrsto veže na enzim RNA polimerazu.
- O-operator je dio molekule DNA koji obavlja regulacijske funkcije, veže se na proteine koji kontroliraju sintezu glasničke RNA u skladu s potrebama stanice.
- A, B, C su strukturni geni (cistroni)
- AUG je signalna trojka
- t – terminator je dio DNA koji signalizira kraj sinteze m-RNA
- ATG, UAG - ovo je triplet signala
Slajd 15
Prokariotski operon
Slajd 16
Operaon ne sadrži nasumične gene, već gene za enzime jednog metaboličkog puta
Opis prezentacije pojedinačne slajdove:
1 slajd
Opis slajda:
2 slajd
Opis slajda:
"NUKLEINSKE KISELINE" Tema lekcije: Cilj lekcije: Okarakterizirati strukturne značajke molekula nukleinskih kiselina kao biopolimera Otkriti mehanizam udvostručenja DNA, ulogu ovog mehanizma u prijenosu nasljednih informacija Naučiti razumjeti bit genetskog koda
3 slajd
Opis slajda:
Njezino Veličanstvo - DNK Švicarski liječnik F. Miescher 1871. godine izolirao je nuklein iz bijelih krvnih zrnaca pacijenata. Ova riječ je izvedena iz latinskog "nux" - jezgra oraha, a završetak "-in" implicirao je da sadrži dušik, poput proteina. Gvanin, prvi izolirao 1858. A. Strecker iz peruanskog guana - ptičjeg izmeta, vrijednog dušičnog gnojiva. Kossel je izolirao timin i adenin iz stanica timusa. Grci su ovu žlijezdu nazivali "adenom", što je značilo "gusta", "tvrda". Timus se još naziva i timusna žlijezda. Po tome je timin i dobio ime. Četvrti spoj izoliran je iz stanica timusa. Budući da je grčka riječ za stanicu "citos", naziva se "citozin". Godine 1910. Kossel je za svoja otkrića dobio Nobelovu nagradu za medicinu.
4 slajd
Opis slajda:
Ribozu je prvi sintetički dobio njemački kemičar E. Fischer, koji je za proučavanje šećera dobio Nobelovu nagradu za kemiju 1902. F. Leuven je 1909. uspio izolirati ribozu proučavajući nuklein. Trebalo mu je još dvadeset godina da izolira deoksiribozu! C. M. McCarthy i K. McLeod dokazali su da je "kiselina tipa deoksiriboze" odgovorna za transformaciju u stanici i o tome pisali u članku objavljenom 4. veljače 1944. Ovaj dan se može smatrati rođendanom deoksiribonukleinske kiseline (DNK) u riječi biološkog smisla. Postalo je jasno da je gen DNK! Godine 1953. Watson i Crick predložili su model dvolančane spirale DNK. Godine 1962. Watson, Crick i Wilkins dobili su Nobelovu nagradu za medicinu za svoje otkriće. R. Franklin je, nažalost, do tada već umro od raka. Da se to nije dogodilo, tada bi po prvi put u povijesti Nobelove nagrade morale biti dodijeljene četvorici... Njezino Veličanstvo - DNK J. Watson
5 slajd
Opis slajda:
BIOPOLIMERNA STRUKTURA DNK fosfodiesterski most između nukleotida baze vodikova veza polinukleotid Nukleotid – fosforni ester nukleozida. Nukleozid sadrži dvije komponente: monosaharid (riboza ili deoksiriboza) i dušičnu bazu. 3" kraj 5" kraj 3" kraj 5" kraj okosnica šećernog fosfata
6 slajd
Opis slajda:
BIOPOLIMERNA STRUKTURA RNA vodikove veze šećer-fosfatna okosnica t-RNA baze Monomeri – RNA ribonukleotidi – tvore polimerni lanac tvoreći fosfodiesterske mostove između ostataka šećera.
7 slajd
Opis slajda:
DNA RNA Sva DNA, bez obzira na podrijetlo, sadrži isti broj purinskih i pirimidinskih baza. Posljedično, u svakoj DNK postoji jedan pirimidinski nukleotid za svaki purinski nukleotid. A=T i G=C A+C=G+T RNK sadrži uracil – U umjesto timina.
8 slajd
Opis slajda:
Samostalni rad Usporedi DNA i RNA Znakovi usporedbe: Položaj u stanici Građa makromolekule Monomeri Sastav nukleotida Funkcije
Slajd 9
Opis slajda:
DNK obavlja sljedeće funkcije: pohranjivanje nasljednih informacija događa se uz pomoć histona. Molekula DNA se presavija, pri čemu prvo nastaje nukleosom, a zatim heterokromatin, koji čini kromosome; prijenos nasljednog materijala događa se replikacijom DNA; implementacija nasljednih informacija u procesu sinteze proteina
10 slajd
Opis slajda:
Multifunkcionalnost RNA Genetska replikativna funkcija. Funkcija se ostvaruje tijekom virusnih infekcija, reduplikacije genetskog materijala. Funkcija kodiranja. U RNK isti tripleti nukleotida kodiraju 20 aminokiselina proteina, a slijed tripleta u lancu nukleinske kiseline je program za sekvencijalni raspored 20 vrsta aminokiselina u polipeptidnom lancu proteina. Funkcija formiranja strukture. Kompaktno složene male molekule RNA slične su trodimenzionalnim strukturama globularnih proteina, dok duže molekule RNA tvore velike čestice ili njihove jezgre. Funkcija prepoznavanja. Funkcija prepoznavanja temelj je specifične katalize. Katalitička funkcija (ribozimi). RNA je sposobna obavljati funkcije oba polimera temeljno važna za život - DNA i proteina.
11 slajd
Opis slajda:
REPLIKACIJA DNA Kontinuitet genetskog materijala osiguravaju komplementarnost, polukonzervativnost (sadrži dio majčine spirale nepromijenjen), antiparalelnost (3'-5'), diskontinuitet, t.j. proces replikacije. Arthur Kornberg (1959.) otkrio je enzim DNA polimerazu.
12 slajd
Opis slajda:
REPLIKACIJA DNA Sudjelovanje enzima: ligaza povezuje kratke, novosintetizirane dijelove fragmenata Okazaki polimeraza pričvršćuje nukleotide u 5 3 smjeru helikaza odmotava dvostruku spiralu, kidanje vodikovih veza primaza je neophodna za sintezu enzima Okazaki kao klica (primer) Replikon - područje između dviju točaka u kojima počinje sinteza lanaca "kćeri". Okazaki fragmenti su novo sintetizirane regije na drugom lancu predloška DNK.
Slajd 13
Opis slajda:
Znanstvenici su predložili različite mjerne jedinice koje predstavljaju količinu podataka povezanih s genetskom strukturom osobe. Toliko je informacija zabilježeno u DNK da ako ih prebacite u knjige i složite te knjige jednu na drugu, njihova visina će biti 70 metara. Znanstvenici su izračunali da ako pokušate rukom napisati ili isprintati nečiju gensku kartu, a onaj koji piše to radi brzinom od 60 riječi u minuti i radi 8 sati dnevno, za to će mu trebati 50 godina. Osim toga, podaci pohranjeni u DNK mogu ispuniti otprilike 200 telefonskih imenika od po 500 stranica.
Slajd 14
Opis slajda:
GENETIČKI KOD Kod je triplet Kod je degeneriran – svaka aminokiselina je šifrirana s više od jednog kodona Kod je nedvosmislen. Svaki kodon kodira samo jednu aminokiselinu. Između gena postoje "interpunkcijski znakovi", unutar gena ih nema. Kod je univerzalan. Genetski kod je isti za sve koji žive na Zemlji
15 slajd
Pitanja za kontrolu
- Što su ugljikohidrati?
- Na koje se skupine dijele ugljikohidrati?
- Koja svojstva imaju ugljikohidrati?
- Koje funkcije obavljaju ugljikohidrati?
- Što su lipidi?
- Na koje se skupine dijele lipidi?
- Koje funkcije obavljaju lipidi?
- Koja svojstva imaju lipidi?
DNK i RNK -
nukleinske
kiseline
Jedinstvenost funkcija proteina
Postoje li druge tvari koje obavljaju iste funkcije?
REGULATORI
ENZIMI
Ostali hormoni, c-AMP, ioni
RNA – ribozimi
PROTEINI
GRAĐEVINA
MATERIJAL
ZAŠTITA
Ugljikohidrati, lipidi
Matrice?
POKRET
PRIJEVOZ
tRNA
Proteini izvode sve funkcije, osim jednog -
INFORMACIJSKI
nesposoban za samoreprodukcija
Ovu funkciju obavlja DNK
njegova glavna i jedina funkcija
- DNK - najveći molekula u stanici. Mnogo je veći od proteina i RNK
- Svaki kromosom = jedna molekula DNA
- 23 ljudska kromosoma = 23 molekule DNA
- Najduži od njih su ≈ 8 cm
- DNK je molekula-tekst. Napisan je slijed njegovih nukleotida cjelokupni nasljedni program tijela
1 DNA molekula
drugi gen
kromosom
kromosoma u jezgri
ćelija
Otkrivena struktura DNK
Datum rođenja
molekularna biologija
Francis Creek
James Watson
Francis Harry Compton Crick
James Dewey Watson
Nobelova nagrada 1962
Rendgenski strukturni portret DNK - poznata fotografija 51
Rosalind Franklin
1920 - 1958
Molekule DNA i RNA mogu se vidjeti elektronskim mikroskopom
DNK bakterijski plazmidi
DNK reovirusa
skeniranje električnih mikroskop
DNA izolirana
iz jednog ljudskog kromosoma
http://users.rcn.com/jkimball.ma.ultranet/BiologyPages/L/Laemmli.gif
DNK i RNK – neregularan polimeri
monomer – nukleotid
sastoji se od 3 dijela
3. dušična baza
2. fosfat
1. šećer
Isti dio
Riboza
deoksi riboza
Fosfat
Dušična baza
Sljedeći nukleotid u lancu
Nukleotid
Dušična baza – jedna od 4
fosfat
Šećer (riboza/dezoksiriboza)
Adenin, A
Guanin, G
Purini
Pirimidini
Citozin, C
Adenin, A
Guanin, G
Purini
Pirimidini
Uklonio je metilnu skupinu
Citozin, C
Uracil, U
1950 Chargaffova pravila
Erwin Chargaff
Chargaffova pravila
[ A ] + [ G ] = [ T ] + [ C ] = 50%
Chargaffova pravila objasnili su Watson i Crick
DNK su 2 lanca povezana prema principu komplementarnost
Načelo komplementarnosti:
- - - - - -
- - - - - -
Izdržljiviji
Slabe vodikove veze!
Principi strukture DNA
Nepravilnost
5 "
3 "
Dvolančani
Komplementarnost
Antiparalelizam
3 "
5 "
Koje značajke u strukturi DNA izravno ukazuju na njezinu funkciju?
(Usporedi sa strukturom proteina)
Razlike između RNA i DNA
- Jednolančani molekule
- Šećer - riboza umjesto deoksiriboze
- U umjesto T
- Mnogo manje– po veličini se može usporediti s vjevericama.
Vrste RNA
- mRNA= messenger RNA, predložak
do 10 tisuća nukleotida
- t-RNA prijevoz
oko 100 nukleotida
- rRNA ribosomski
2-3 tisuće nukleotida
linearni
poput proteina, imaju
3-dimenzionalna konformacija
Stvaranje sekundarne strukture RNA
Shema stvaranja petlje u RNA
zbog komplementarnih regija
Prijenosna RNA
~100 nukleotida
"list djeteline"
Ribosomska RNA
Najveća od svih vrsta RNA -
2-3 tisuće nukleotida
16 S rRNA
Funkcije RNA redoslijedom kojim su otvarani
- Informacijski: implementacija informacija
Sve vrste RNA su posrednici u prijenosu informacija s DNA na protein
Mjesto susreta sve tri RNA je ?
ribosom
Funkcije RNA redoslijedom kojim su otvarani
- Informativno: pohranjivanje informacija (za neke viruse)
- Otprilike 80% ljudskih i životinjskih virusa koristi RNA za bilježenje informacija
- U njima ona ima istu ulogu kao DNK u svim drugim organizmima.
Funkcije RNA redoslijedom kojim su otvarani
- Katalitički 1982
Ribozimi – RNA enzimi
Ne sve RNA, već samo neke:
rRNA ribosomi,
RNA nekih virusa
RNA u spliceosomu
Adresa slike http://commons.wikimedia.org/wiki/Image:Minimal_hammerhead_ribozyme_structure.png
Thomas Check
Minimalni ribozim sposoban cijepati RNA
Funkcije RNA redoslijedom kojim su otvarani
- Regulatorni 1990-ih
Male RNA reguliraju funkciju gena u jezgri i sintezu proteina u citoplazmi
Slično funkciji proteina koji vežu DNA
RNA kombinira svojstva
- DNK– princip komplementarnosti, koji omogućuje matrično kopiranje molekule
- Belkov– trodimenzionalna struktura koja vam omogućuje da izvedete najviše različite funkcije(kataliza, regulacija, transport)
Kopiranje matrice
3-D oblik i različite funkcije
Protein
Ovo nije kraj
ali tek početak
“Nukleinske kiseline” - 1892 - kemičar Lilienfeld izolirao je timonukleinsku kiselinu iz timusa 1953. godine. Biološka uloga nukleinskih kiselina. Duljina molekula DNA (američki biolog G. Taylor). Dušična baza. James Watson i Francis Crick dešifrirali su strukturu DNK. Struktura nukleotida. Usporedne karakteristike.
“DNK i RNK” - James Watson i Francis Crick otkrili su istinu 1953. Fosfat. Kako riješiti problem prijenosa nasljednih informacija? Nukleotidi se sastoje od: Kako živi sustavi bilježe informacije o svojoj strukturi. Monomeri nukleinskih kiselina su. DNK Saharid. Nukleotidi susjednih paralelnih lanaca povezani su vodikovim vezama po NAČELU KOMPLEMENTARNOSTI.
“Struktura DNA i RNA” - Struktura DNA. Rosalind Franklin. Ribosomska RNA. DNK. Shema stvaranja petlje u RNA. Zavojnica. Kraj lanca. Objašnjenje Chargaffovih pravila. Fosfat. Prijenosna RNA. DNA i RNA molekule. Adenozin trifosfat. Ostaci fosforne kiseline. Biološke molekule. Ribonukleinska kiselina. Nukleinske kiseline.
“Vrste nukleinskih kiselina” - Opća struktura. Hidroliza. DNK polimerna molekula. Struktura DNK. Početak i kraj lanaca. Fizikalno-kemijska svojstva nukleinskih kiselina i njihovih otopina. Dvije molekule DNA. Struktura RNA. DNK polimerni lanac. Kemijska svojstva RNA. strukture DNA. Struktura RNA. Kemijska svojstva DNA. Klasifikacija. Spiralni oblik.
“Kemija “nukleinskih kiselina”” - Ključne riječi. Formiranje superheliksa DNA. Nukleinske kiseline. Vrste RNA. Struktura kromatina. Razumijevanje međusobne povezanosti i međuovisnosti tvari. DNK je dvostruki lanac. Pitanja za samokontrolu. Spiralni korak. Nukleotid. Riješiti problem. Struktura i funkcije. Pregledajte podatke analize DNK.